ولدمكرم اسكندر نقولا في  19 يوليو 1942 م. بمدينة المنصورة. ولكن والده أصلاً من دمياط.من أسرة عريقة ومتدينة. فهو ينسب نفسه الى عائلة شهيد معروف قتل علي يد الغوغاء في ايام محمد على اسمه  سيدهم بشاي.مات  والده المهندس إسكندر نقولا وتركه في سن الرابعة من عمره، فتولى عمه الأستاذ ألفونس نقولا تربيته ورعايته بدمياط.تلقى دراسته الأولى في بورسعيد، ثم ذهب إلى الإسكندرية حيث حصل على بكالوريوس الهندسة (قسم كهرباء) بتقدير امتياز عام 1963 م. من جامعة الإسكندرية وكان عمره في ذلك الوقت أقل من 21 سنة.عُيِّنَ معيدًا بكلية الهندسة بالإسكندرية. وتقدم في الدراسة للحصول على درجة الماجستير في الهندسة الميكانيكية. فحصل على درجة الماجستير في يوم 28 مايو 1968 م.ومن الناحية الروحية تأثر نيافته بالقمص بيشوي كامل، والقمص تادرس يعقوب ملطى.أيضا تأثر نيافته بقداسة البابا شنوده الثالث -كما يقول عن نفسه - "خصوصًا أثناء القداس الإلهي الذي كان يصليه بروحانية عجيبة.. ورأيت فيه صورة الراهب الحقيقي".كان لكلمات قداسة البابا شنوده عن حياة الرهبنة  في مؤتمرات الخدام بكنيسة مارمينا بالمندرة – الإسكندرية تأثيرها العميق، والشعور بالدعوة الخاصة لحياة التكريس.ويقول "قررت الذهاب إلى الدير (دير السريان) يوم 30 مايو 1968 م. واتخذت قداسة البابا شنوده أسقف التعليم حينها مرشدًا روحيًا وأب اعتراف لي".ترهب يوم ألاحد سنة 1969.باسم الراهب توما السرياني نسبه الى دير السريان رسم قسًا (تاريخ الكهنوت) في يوم أحد الشعانين (أحد السعف) يوم 12 إبريل 1970 م. ورسم قمصًا في 17 سبتمبر 1972 م.ورسم اسقفا في 24 ستمبر 1972ومطرانا 1990

تم اختيار ه  سكرتيرًا للمجمع المقدس (بعد الأنبا يوأنس) عام 1985 م. حتى عام 2012 بعد رحيل قداسة البابا شنوده الثالث،

يتعامل الانبا بيشوى مع المراة كجسد لابد ان يتغطي وكثيرا ما يطالبها بالحجاب ويطالبها بالتشابه بالاخوات المسلمات وقامت مظاهره ضده في الكاتدرائية وقت ان كان الانبا باخوميوس هو القائمقائما البابا شنودة والغريب انه الاسقف الوحيد الذى يراس دير للراهبات في وضع شاذ بالفعل وهو دير القديسة دميانة ببراري بلقاس