لا تكف جماعة الإخوان المسلمين في الأردن عن إظهار خلافاتها السياسية التي تنشب كل فترة بين أعضائها بسبب المصالح والمنافع الحزبية التي ترغب في تحقيقها الجماعة، بمشاركتها في الحياة السياسية، وهو ما أحدث انشقاقًا بين أعضائها جعل الكتلة المتشددة تسيطر على الجماعة وتواجه كل من يخالفها الرأي بالفصل والإقصاء من التنظيم. 

 مما سبق نستطيع أن نؤكد أن هذه الخلافات جزء من خلافات تاريخية شهدتها الجماعة في الأردن بداية من عام 1997، عندما قدمت قيادات بارزة استقالاتها من الجماعة احتجاجًا على قرار مقاطعة الانتخابات النيابية، وفي عام 2007 عندما أعلنت قيادة الجماعة حل نفسها إثر خسارة فادحة منيت بها في الانتخابات، وفي الأعوام 2009 و2010 على خلفية قضايا تنظيمية بينها مطالبات بفصل ما عرف بالمكاتب الإدارية الخارجية المرتبطة بعلاقة تنظيمية بين الإخوان الأردنيين وحركة حماس الفلسطينية وهو ما يؤشر على أن الخلافات داخل الجماعة تتصاعد؛ مما يدفع بقوة نحو تصدع التنظيم الإخواني في الأردن.