بعد وفاة  البابا بطرس الخامس تم اختيار الراهب غبريال من دير شهران بطريركًا وتمت رسامته في 5 سبتمبر سنة 1348 م.باسم مرقس الرابع (1348 - 1363 م.) وكان من بلدة قليوب وولد باسم فرج الله 

في أيامه صودرت أملاك الكنيسة والأديرة القبطية وكانت تبلغ 25 ألف فدان كلها موقوفة للكنائس والأديرة.وفي أيامه حدث فناء عظيم في القرى أتى بالخراب على معظم القرى المصرية.

كانت أواخر أيام الملك الناصر هادئة نوعًا ما. ولما تولى الملك الصالح الثاني في سنة 752 هجرية (1068 ش. الموافقة 1351 م.) حدث في عهده سنة 754 هـ (1069 ش.) وباء الطاعون وانتشر حتى عَمَّ البلاد بلا رحمة.

وفي أوائل سنة 755 هـ الموافقة 1071 ش. (1354 م.) رفع المسلمون تقارير مفصلة بما للنصارى من الأملاك الموقوفة للأديرة القبطية، فأحيلت هذه التقارير إلى ديوان الأحباش، وعرضت على الأمير شيخو والأمير صرغتمش والأمير طاز، وكانوا قائمين الدولة فقرروا، أن ينعم بهذه الأملاك على الأمراء زيادة على إقطاعاتهم!