يعمل جهاز مُكافحة الإرهـاب بالعراق علي محورين لمواجهة الفكر المتطرف.المحور الاول مطاردة فلول داعش حيث قام الجهاز  بالقاء  القبض على الإرهابـي" طه علي محمد ناصر الجنابي" المُكنى " ابو عائشة " والذي كان قد بايع التنظيمات الإرهابيـة مُنذ العام ٢٠٠٤ عند مُحاولته الدخول إلى العاصمة بغداد لتنفيذ عمليات إرهابية حيث كان بإنتظاره رجال المخابرات  فور وصوله .اما المحور الثاني فهو التصدي الفكري للارهاب واستكمالا للجهود العلمية لجهاز مكافحة الارهاب بالانفتاح العلمي والثقافي في مختلف الميادين اقام جهاز مكافحة الارهاب سلسلة محاضرات وورش عمل بالتعاون مع مختلف الوزارات والدوائر غير المرتبطة بوزارة ومنها محاضرة في الاكاديمية العسكرية في الكلية العسكرية الاولى عن مخاطر الارهاب والفكر المتطرف بالاضافة الى ورشة تعريفية بفعاليات جهاز مكافحة الارهاب ومدى انسجامها مع اجراءات حقوق الانسان في وزارة العدل - دائرة حقوق الانسان على عدد من مسؤولي منظمات المجتمع المدني (المحلية والدولية) والتي تعمل في مجال مراقبة حقوق الانسان والانتهاكات التي ترافق عمليات مكافحة الارهاب .

ان احد اهم اهداف الاستراتيجية العراقية لمكافحة الارهاب هو التعريف بمهام وواجبات الجهاز وطرق عمله ومحاولة التنبيه الى بعض الجرائم الارهابية وتحصين الشباب من الانجراف نحو التطرف الفكري المؤدي الى الارهاب.