لا شك أن الانقسام داخل صفوف الجماعة الإرهابية قد أثر كثيرًا على أدائها في الشارع، وأفقدها مصداقيتها بين المصريين بشك عام وفي أوساط حركات الإسلام السياسي بشكل خاص، خصوصًا بعد الهجوم عليها من قِبل بعض رموز الإسلام السياسي وحركاته مثل عاصم عبد الماجد القيادي بالجماعة الإسلامية والهارب والمقيم بقطر، وكذلك جبهة إصلاح الجماعة الإسلامية وحزب النور وغيرهما من الحركات الإسلامية وقياداتها، إلا أن الجماعة في الداخل ما زالت مصرة على النهج الإرهابي في مواجهة الشعب المصري والسلطة المصرية، رغم تعارض ما تقوم به مجموعة الداخل مع التوجه العام للقيادات بالخارج، وهذا ما يزيد من حدة الانقسامات الداخلية من ناحية، ومن ناحية أخرى يزيد من عزل الجماعة وإقصائها جماهيريًّا.